神奇宝贝也依据属性进行划分，不同属性的神奇宝贝有所克制和所不利的属性，属性一共有18种，神奇宝贝可以有一个或两个属性。
地理和自然：
神奇宝贝世界和现实世界在地理上有相似之处。都有大陆、海洋和适合生物生长的天气气候，所以神奇宝贝世界的体积和与恒星间的距离均与地球相近，有相似的月亮，相似的气候和潮汐。许多地方也揭示了神奇宝贝世界和现实世界存有相关之处。
人类和自然在神奇宝贝世界和谐相处，许多城镇依自然环境而建。值得一提的是，和现实世界不同，神奇宝贝世界中的人类和自然有着更紧密的联系，除了极少数的敌对组织之外，人类的建设极少影响到自然环境。固拉多和盖欧卡等神奇宝贝还可以影响自然环境，带来无法解释的干旱、暴雨和地震。
神奇宝贝世界分为多个地区，包括关都、城都、丰缘和神奥地方等。除了这些地区之外，还有不属于任何一个地区的岛屿，岛屿之间可以组成群岛，比如橘子群岛、杰可罗拉群岛和七岛。虽然地区之间有一些共同点，但也有一些显著的不同，比如神奇宝贝的分布，神话、历史以及传说。无论从气候还是人文方面，从不同地区前来的游客都能感受到当地与家乡的不同。由于术语全国图鉴的存在，这些地区可能同属一个国家，亦或整个世界是唯一的一个国家。在神奇宝贝主系列游戏中只有5个地区，欧雷和菲蕾地方等地则在其它游戏中出现。动画中另外还提到了一些小型的王国，位于难以到达的地方。
关都、城都、丰缘、神奥地方的地理与现实世界日本的地区具有相似之处。关都地方可以对应日本的关都地方和中部地方的东部，而城都地方则对应中部地方的西部和关西地方，丰缘地方对应日本的九州地方和冲绳县一部分，神奥地方的设计原型则是北海道、国后岛和库页岛的一部分。
合众地方的设计原型则是来源于纽约，似乎于不同以往，但也体现了设计者的深意。卡洛斯地方的设计原型则是来源于法国。
气候：
许多地区都有不同的气候。较南方的地区和岛屿例如丰缘地方和橘子群岛相较北方显然更暖和。而神奥地方则比其它地区要凉爽，并且因为发生的气候变化更变得愈发寒冷。在神奥北部还有常年的积雪。一些神奇宝贝比如固拉多、盖欧卡、烈空坐可以影响气候和天气。
神奇宝贝世界同样有天气变化，有阴晴雨雪和水循环。许多在地球上存在的天气在神奇宝贝世界当中同样存在，例如下雨、冰雹、下雪、浓雾、沙尘。神奇宝贝世界有植物和树木的正常生长，所以可以推断碳循环、氮循环在神奇宝贝世界同样也是存在的。
环境：
神奥地方最高的山峰天冠山，顶上是破格的世界的入口
神奇宝贝世界的自然环境与地球相近，树木聚集形成森林，不毛之地成为沙漠，松软的沙粒形成吸引人类和神奇宝贝游玩的海滩。丰缘和神奥地方还有热带雨林和大片雪地等多种丰富的环境。
神奇宝贝世界被繁茂的绿色覆盖，树木、灌木、草丛等植物分布在世界各处。高草丛成为了野生神奇宝贝的栖息之处。神奥传说之中这样解释了人类走到高草丛里神奇宝贝就会出现：神奥刚刚出现的时候，神奇宝贝认为它们应该永远准备帮助人类。在世界中还有高山和平原，最大的山峰是天冠山，将神奥地方分割成东西两部。人造和自然之景，比如洞窟和隧道可以帮助人们通过高山，到达另一座城镇。神奇宝贝世界的一些自然现象，比如火山灰，是由附近的火山所形成的。
人类和自然是神奇宝贝世界里紧密共存，许多城镇依自然环境而建，而并不影响自然。例如暮水镇建在漂浮于太阳珊瑚群的木筏之上，琉璃市则环绕在中空的火山口。植物、神奇宝贝和人类共享着同一片生态环境，而神奇宝贝相较人类更能适应自然。
物理和科技：
神奇宝贝世界的科学技术比现实世界更要先进，科技的进步可以使神奇宝贝存放于电脑中，把神奇宝贝发送的世界各地，复活化石创造出古代神奇宝贝，虽然人类的生活依旧朴素自然。能量转换等科技成就和进化、可以记录事件的花等奇特自然现象使得神奇宝贝世界和现实世界存有很大的不同。得文制造股份有限公司的一些研究员还在尝试更加先进的科技想法，比如将神奇宝贝的梦境投影，和神奇宝贝直接交流，将人类变成神奇宝贝（正辉曾意外造成这样的事件）等等。制造失重的机器和基本的交通方式比如自行车和卡车一同存在。
精灵球，神奇宝贝世界最常用的科技
神奇宝贝世界最为先进和常用的技术之一是神奇宝贝球，可以把神奇宝贝收纳到口袋中的小球里。在对战中，如果对手野生神奇宝贝的体力减弱，训练家就会扔出宝贝球。如果宝贝球击中了神奇宝贝并且没有被弹开，宝贝球就会张开，把神奇宝贝收入其中，然后关闭。接着在宝贝球摇晃的期间，如果神奇宝贝没有挣脱宝贝球，那么就算收服成功。宝贝球最早来源于圆柑果实而非人工制造，近代的宝贝球需要人工拧开螺丝将神奇宝贝放出。宝贝球有各种各样，分别用于不同的用途和场合，掌门球可以万无一失地收服神奇宝贝。
尽管神奇宝贝世界有各种